甲亢引起的心房颤动的治疗主要包括：一、基础疾病的治疗。积极的控制甲亢能够有效的控制房颤。二、心室率的控制。对于快速发作的房颤，可以使用抗心律失常的药物，如贝塔受体阻滞剂、胺碘酮、洋地黄类药物。三、抗凝的治疗。需要根据评分决定患者是否使用抗凝治疗，抗凝的药物包括华法林和新型的口服抗凝药物。四、复律的治疗。可以通过直流电复律、射频消融术、冷冻消融术等恢复窦性节律。