儿童的直肠息肉大多数可以通过手术切除治疗。最常用的方式是如果息肉位于直肠下部，可以通过肛门直视下将息肉切除，在体表并无切口，不影响外观。如果息肉位于直肠上部，无法通过肛门直接手术切除。可以选择肠镜监视下将息肉切除。