甲状舌管囊肿在诊断明确后，应争取在感染发生之前手术切除，无感染的囊肿可在患儿两岁以后手术。 对于最近有感染的患儿在手术前30分钟应给予抗生素。因囊肿蒂部与舌骨相连，瘘管多通过舌骨的中央，故手术中应切除舌骨中段1厘米，这样可以避免瘘管细小分支的残留而发生复发。 甲状舌管囊肿一般为1至2厘米的直径圆形肿块，边缘清楚。往往因囊内分泌物充盈紧张，肿块有实质感。肿块可随伸舌运动而上下移动，此为其特征。 未发生感染的病例，囊肿不与皮肤粘连，无压痛也不影响吞咽活动，当囊肿发生感染时，表现为疼痛、压痛及皮肤发红，向外破溃时流出脓性分泌物，以后在囊肿与皮肤之间形成一条窦道。