怀孕三个月头痛常见的原因有感冒、脑供血不足、颅内占位性病变、脑神经功能失调等等。 但是到底是什么原因引起的头痛，这种情况是需要到医院去就诊做检查的，我们要判断是功能性失调引起的头痛，还是器质性的问题引起了头痛。 如果要做这方面的检查，我们一般是要做头颅的磁共振检查，由于怀孕期间做CT检查，可能会有一些辐射，所以为了安全，可以做头颅的磁共振检查，因为头颅的磁共振，它没有辐射。