扁平疣的中医治疗多采用内置与外置相结合的治疗方法，对于风热血燥症者多选用自由方加板蓝根、夏枯草，湿热血瘀证者多选用马齿苋合剂加薏仁、冬瓜仁，风热蕴结证者多选用马齿苋合剂加木贼草、浙贝母、板蓝根，热淤互结者多选用桃红四物汤加生皮、板蓝根、紫草、马齿、浙贝母、薏苡仁，外治法通常选用木贼草、板蓝根、马齿苋、苦参皮、白鲜皮、薏苡仁等中药煎汤，趁热洗涤患处，每天2到3次，可使部分疣体脱落。