肛瘘如果恶化了，有可能会出现高位的复杂性的肛瘘，到时候就有肛门失禁的风险，除此之外，如果出现了急性发作，就有可能导致肛周脓肿。 时间长了，慢性刺激，有可能会出现肛门湿疹，而且如果肛瘘的时间特别长，有可能会出现癌变，形成一个肛管癌或者肛门周围癌。肛瘘本身是一种肛门周围疏松间隙的一种慢性肉芽肿性感染性疾病，如果时间长了，随着细菌感染到处扩散，就有可能会形成这种高位的复杂性肛周脓肿。除此之外，如果肛瘘急性发作的话，有可能就会形成这个所谓的肛周脓肿。而且由于其肛瘘长期慢性的，反复的分泌物的刺激，从而有可能会出现所谓的肛门湿疹。分泌物反复的刺激，时间久了，有可能会出现肛门周围的癌变的情况。