眼睛长扁平疣主要是因为眼部皮肤粘膜感染人乳头瘤病毒所致，该病病毒主要是人乳头瘤病毒三型为主。扁平疣主要好发于儿童和青少年部位，主要好发于颜面，手背及前臂等皮肤。 典型的皮肤表现为比米粒至黄豆大小的扁平隆起性丘疹，圆形或椭圆形，表面光滑，质地偏硬，呈正常肤色或淡褐色，多数突然出现，数目比较多，而且密集分布，反复搔抓后皮损可呈串珠状排列。即自体接种反应，该病病程呈慢性，在所有临床型人乳头瘤病毒感染中自行消退率最高，少数患者可出现复发。