目前，临床上最常用的用于肛裂的药是硝酸甘油软膏，它可以松弛肛门内括约肌，消除其痉挛状态，从而增加伤口局部的血供，为伤口的愈合提供足够的营养物质以及氧气，从而促进伤口的愈合，其临床疗效是比较确切。 但是要注意硝酸甘油软膏也有一定的不良反应，最常见的是引起头痛，少数人头痛会比较严重且持续较长时间，这时要注意及时减量或者停止使用。此外，硝酸甘油软膏还会引起其他的不良反应，比如头晕、恶心、心跳加快、视力模糊、疲劳等。因此，使用的时候要注意仔细看说明书或者咨询医生或药师。除了硝酸甘油软膏之外，中成药制剂如马应龙麝香痔疮膏，对肛裂也能起到良好的缓解作用。但是要注意的是，肛裂有急性肛裂和陈旧性肛裂两种。药物治疗对急性肛裂的效果更好些，对于陈旧性肛裂，特别是合并有哨兵痔、肛乳头肥大栉膜带等病理特征的肛裂，往往需要手术处理。