巧克力囊肿，怀孕后是否消失要看巧克力囊肿的大小，巧克力囊肿的发生是由于子宫内膜异位到卵巢上，在每次来月经时异味的子宫内膜会发生出血，局部包裹形成囊肿，如果巧克力囊肿在三公分以内，在怀孕期间长达十个月以上的，不来月经，卵巢囊肿会逐渐缩小，如果产后很快恢复月经囊肿，可能会再次形成，如果巧克力囊肿非常大，在怀孕期间消失的可能性就会降低，产后恢复月经巧克力囊肿会再次增大