注射完手足口病疫苗后发热考虑是注射疫苗后引起的疫苗反应，由于疫苗大多都是减毒活疫苗，一部分接种疫苗后，会出现发热、起皮疹等疫苗反应，如果发热时体温是在38.5摄氏度以下一般不需要过多担心，可以进行物理降温，多喝温开水等方法处理，一般一到两天后即可好转，若体温升高到39摄氏度以上或者反复、持续发热超过3天以上，建议尽快到医院就诊，全面检查。