眼睛的扁平疣比较复杂，因为这个部位接触了眼睛的结膜，结膜是比较卫生比较敏感的部位，如果使用一些外用的药膏进行涂抹，比如说阿昔洛韦、更昔洛韦的药膏，或者是干扰素凝胶，这些涂抹的话可能会导致药膏进入的结膜里面，刺到眼睛的结膜，导致视力的下降，或者眼睛的过敏现象，所以尽量不要用药膏治疗眼睛的扁平疣，那么应该用什么东西来治疗眼部的扁平疣呢？首选治疗方法就是液氮冷冻治疗，也可以采用电刀切除的方法进行治疗，再不行，你可以使用激光切除治疗，效果会直接一些，对眼睛没有什么危害，所以在医生的指导下，眼部的扁平疣最好不要擦药膏治疗，使用一些物理的方法进行治疗。