奥美拉唑对萎缩性胃炎有一定效果，但不建议长期服用。萎缩性胃炎，如果不伴有临床症状，如恶心，反酸，烧心，腹痛等不适，可以不口服奥美拉唑，单纯口服胃复春或摩罗丹治疗即可，疗程在3到6个月甚至更长，部分患者可服用1到2年的时间，期间定期复查胃镜，观察胃粘膜修复情况。如萎缩性胃炎伴有上述不适症状或胃镜检查提示胃内存在糜烂等，则建议口服奥美拉唑，疗程在2到3周的时间。待上述不适症状缓解或胃黏膜修复后即可停用奥美拉唑，继续口服胃复春和摩罗丹。