激光去除扁平疣有复发的可能。 该病除了使用激光治疗以外，还可以选择外用药物治疗和系统药物治疗。其中，外用药物治疗适用于皮损较大且不宜使用物理治疗的患者。药物可以选择0.05%到0.1%的维a酸软膏，每天1到2次外用，还可以选择5%的米奎莫特软膏每周使用三次治疗，两种药物都有一定的疗效。 其中系统药物治疗目前尚无确切有效的抗人乳头瘤病毒治疗的药物，可以使用免疫调节剂。以比如干扰素、左旋米唑等，此外还可以选择中药治疗，主要以清热解毒，散风平肝、散结为治疗原则，有时可获得较好的疗效。