怀孕40天药物流产的话会有一定的疼痛的感觉的。 现在一般情况下，如果应用药物流产的话，大部分是考虑给予米非司酮联合米索前列醇进行药物流产。如果说是药物流产的话，应该是先应用米非司酮，应用米非司酮的时候一般不会出现疼痛不适的感觉。但是如果说是应用米索前列醇的话，就会出现肚子疼痛。每个人的疼痛的程度是不一样的，有的人可能疼痛地比较轻。对于经产妇宫口比较松的话，一般情况下疼痛地是比较轻的。但是有的人可能疼痛地比较严重，比如说是有的人如果说是宫颈口比较紧，宫颈质地比较硬的话，就有可能会疼痛地比较严重。所以，每个人的情况不一样，具体疼痛的程度也是不能确定的，而且疼痛的程度与个人的忍受性也是有一定地关系的。