多囊卵巢怀孕对于胎儿是有一定影响的，多囊卵巢首先容易出现卵子发育不好的情况。 如果受精卵是由发育不好的卵子形成的，那么在怀孕早期容易出现胚胎停育。在怀孕中晚期可能会出现胎儿大的器官畸形，比如二十一三体综合症、十八三体综合症、唇腭裂等等。另外多囊卵巢的患者大多会存在卵巢黄体功能不足的情况，黄体功能不足可以引起怀孕早期自然流产， 也容易导致不规则出血，而先兆性流产。对于胎儿自身也是有一定影响的， 长时间出血可能导致胎儿宫内发育迟缓。