桥本氏甲状腺炎降抗体的治疗主要是调控自身免疫功能紊乱的治疗，有报道采用地塞米松甲状腺内注射可有效缩小甲状腺，降低血清甲状腺抗体的水平，减少甲减发生率。硒作为一种必需微量元素之一，具有抗氧化，调节免疫系统功能等，动物实验研究显示，硒治疗自身免疫性甲状腺炎，大鼠可以使甲状腺抗体水平明显降低，甲状腺内淋巴细胞浸润明显减少，滤泡破坏程度减轻。在中医药基础研究中，发现有些单味中药，或方剂对实验性自身免疫性甲状腺炎小鼠，具有抑制体液免疫系统产生自身抗体的作用，这些都是降低甲状腺抗体的方法。