多囊卵巢属于妇科内分泌疾病，卵巢囊肿的种类有很多，这两种囊肿有明显的区别。多囊卵巢主要的临床表现就是月经稀发不排卵，肥胖体毛多，B超提示双侧卵巢有10个以上的小卵泡发育。而卵巢囊肿有生理性和病理性之分，生理性囊肿一般是指黄体囊肿，排卵后形成月经干净后消失，病理性囊肿有好多种，比如浆液性囊腺瘤，粘液性囊腺瘤，进一步的诊断需要通过手术病理检查进行诊断。