注射乙肝疫苗一般没有咳嗽副作用，也就是说咳嗽与注射乙肝疫苗并无直接联系，乙型肝炎疫苗注射后可能产生一些副作用，如低热、局部疼痛等，不会引起咳嗽，应考虑其他原因导致的，如上呼吸道感染、支气管炎等，建议去儿科进一步检查明确诊断，找出病因，进行治疗。