咽喉疼痛伴随口臭的原因是非常多的。比较常见的原因就是炎症反应导致的，比如急性化脓性扁桃体炎，传染性单核细胞增多症，慢性咽喉炎，也有一部分患者是由于扁桃体结石，扁桃体癌导致的，还有一部分患者是由于喉癌，下咽癌引起的，具体的发病原因有个体差异，出现这种情况之后，建议到耳鼻喉科就诊，可以做血常规检测，喉镜检查。这样就有助于判断病情，明确诊断。明确病情以后就可以进行针对性的治疗。需要定期到门诊复查，观察治疗效果。