男性生殖系统之所以会流脓，绝大多数是由于性病引起的，一般淋病会引起尿道口流脓，淋病是一种性病，主要通过无保护性行为传播，淋病的典型表现是排尿刺痛和尿道口流脓，可以到医院进行尿常规和分泌物涂片检查来进一步明确诊断。一旦确认为淋病，建议性伴侣双方同时治疗，因为这是一种性病，对这种病一定要引起重视，否则时间久了有可能会造成尿道狭窄，无法通过尿道排尿，需要在肚子上插一个管子，做膀胱造瘘引流尿液，淋病一般是建议应用两种抗生素，共同治疗最常用的药物是头孢克肟，加盐酸左氧氟沙星，在治疗期间注意多喝水，不要喝酒，不要吃辛辣刺激的食物。