导致乙肝妈妈阻断失败的原因有三种，第一种原因，是因为宫内传播，婴儿在母体内的血液循环可以通到胎盘感染乙肝病毒，这种传播方式，需要做宫内传播，这种方式引起的新生儿感染，在15%左右，母婴阻断发生失败可能是因为宫内感染出现，另外就是乙肝疫苗接种时间，一般来讲新生儿出生后24小时内及时接种乙肝疫苗，是有效的阻断容易传播的重要的方式，越早接种效果越好，阻断的成功率是很高的，但是如果在出生之后，48小时内接种乙肝疫苗，就会降低免疫的能力，可能会导致阻断失败，另外，分娩前后体内的乙肝病毒的含量，可能跟母婴传播呈一定的关系的，高病毒感染的孕妇，就可能会使用一些抗病毒药物，将病毒下降下来，提高容易阻断成功率。