腰痛和月经不干净，应该是没有必然的联系。

如果经常出现月经的不干净，最常见的原因是内分泌失调引起的月经不调。腰痛，考虑到有可能是腰肌、腰椎或者是泌尿系的问题，这两个问题需要分开来做检查。如果平时月经规律，同时，又有性生活，突然间出现阴道出血时间较长，同时，伴有腹痛，那需要考虑到是怀孕。最常见的这种现象，可能是先兆流产或者是宫外孕的可能。如果经常的出现阴道不规则的出血，最常见的原因是内分泌失调。其次，要排除子宫器质性的病变，比如子宫肌瘤，子宫腺肌症，子宫内膜憩室，子宫内膜息肉等等。