多动症药物治疗对孩子的副作用主要是食欲减退，影响孩子的睡眠，有时还会出现腹痛、心率加快、嗜睡等，长期的使用也可能对孩子的身高体重也有一定的影响。

在临床上多动症，常用的药物是中枢神经兴奋药和盐酸托莫西丁。中枢神经兴奋药有哌甲酯速释片和哌甲酯控释片，一般适用于六岁以上的孩子，六岁以下和颠痫的孩子慎用，用药从小剂量开始，根据疗效和不良反应，调整用药剂量，盐酸托莫西丁适用于六岁以上的孩子，根据情况调整用药剂量。