甲巯咪唑是甲亢治疗的首选药物，常见的副作用有以下几个方面，第一，过敏，服用甲巯米唑的患者可能会出现皮疹，这时一般可以服用一些抗过敏药物，如果出现严重的过敏反应，则需要停药。

第二，肝功能损伤，甲亢的患者本身会引起肝功能损伤，甲巯米唑也会导致转氨酶的升高，如果轻度升高，一般服用保肝药就可以，如果有重度升高者，需要停药。

第三，白细胞减低。甲巯咪唑可能会抑制白细胞的生成，如果发生严重的白细胞减退者，需要停药。