黄体囊肿，是一种生理性的囊肿，在B超上会提示不均质的，并且是血流信号，相对来说比较丰富，而巧克力囊肿往往会表现出致密的斑点状回声。里面的囊液也是比较粘稠的，所以这两种囊肿在b超上还是很好区分的。

另外，为了明确是否为黄体囊肿和巧克力囊肿，可以进一步检查，比如黄体囊肿，在月经来潮的第五天，会自然消失的，所以在这个时候，再进行一次b超复查，如果是黄体囊肿，囊肿就会消失掉，不存在。而巧克力囊肿，在月经的第五天是仍然存在的。同时，巧克力囊肿的患者，往往会伴随有血CA 125指标升高。