肛周脓肿的区别主要有以下几点。

第一点的话就是概念上的不同，肛门脓肿的话，它相对来说更广义上讲更宽阔一些，有可能包含了肛周脓肿，肛周脓肿的话主要是指的是肛门周围间隙、细菌感染、化脓感染之后形成了一个脓肿，肛门脓肿的话，不仅仅包括肛周脓肿，还包括肛门的皮肤粘膜以及全部的这种化脓性脓肿病变，都是有可能。

第二种情况的话就是处理方法有一定的区别，肛周脓肿的话做了切开引流术，有可能会在这种肛门周围疏松的间隙，形成一个所谓的肛瘘，而这种肛门脓肿有可能就是简单的一个浅表的脓肿切开引流之后，很快就会好了，理论上讲是不太可能形成所谓的肛瘘。