多发性乳腺囊肿可能原因是乳腺组织增生或乳腺导管结构异常，导致液体分泌后集聚其中形成。

它的发病主要与下列因素有密切的关系。月经周期的激素水平变化，体内雌激素水平异常升高刺激乳腺组织增生。乳腺囊肿大小不一，部分囊肿的体积很小，只有在影像学检查时才能看到。也有部分囊肿的体积较大，直径可以达到2到5厘米。可能会压迫周围乳房组织和神经，造成明显的疼痛和不适的症状。一般来说，35岁至50岁的女性，卵巢功能紊乱的女性，以及哺乳期的妇女，绝经后接受激素替代治疗的妇女更容易发生乳腺囊肿。