发烧引起的头痛一般是见于感染因素，首先可以予以对症处理，通常予以非甾体抗炎类药物应用，比如口服布洛芬或萘普生等药物，也可以肌注安痛定等，可以帮助退烧及止痛。

同时需要对因治疗，查明造成发烧及头痛的原因，在炎症感染因素下所释放的炎性介质引起发烧及头痛，需要去除病因后才能防止反复的发烧及头痛症状。导致发烧及头痛的感染因素可见于病毒、细菌等不同的病原体，可以是身体各个不同系统的炎症感染。在查明原因以后予以抗病毒和抗炎等药物控制感染，以免病情反复。