微创肾结石手术对肾脏的危害不是特别大，但是对肾脏是有一定影响的。

微创肾结石手术包括两种，一种是经尿道、输尿管软镜、肾结石、钬激光碎石，另一种是经皮肾镜碎石。输尿管软镜碎石，对身体不会有任何的创伤，因此对人体的影响是比较小的，但是经皮肾镜碎石，需要通过腰背部穿孔到达肾盂集合系统，对肾实质有一定的损伤。有些患者在手术以后的若干年，可能会形成肾萎缩。如果这一侧的肾脏已经没有功能。这一侧的肾脏如果要进行经皮肾镜手术，一定要慎重，否则有可能会造成肾功能下降、肾功能衰竭甚至尿毒症的情况发生。