益生菌在肠道环境的综合作用下，会产生乳酸、醋酸等酸性的物质，能够刺激肠道分泌大量的肠液，对粪便能够起到软化的作用。

益生菌作用下形成的酸性的环境，能够增强结肠的蠕动，有利于粪便的排泄。益生菌作为药物制剂，可以是一种或者是几种益生细菌，如双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、肠球菌。

一般来说药物制剂中的益生菌含量是很大的，存活时间也是比较长的，常被利用于治疗肠道菌群紊乱导致的各种疾病，益生菌对便秘是很有效果的。