引起莫名肌肉酸痛的原因有很多，比较常见的有以下一些情况。

第一可能是细菌、病毒、真菌感染，患者由于感染细菌、病毒、真菌等导致，如流行性感冒病毒引起全身酸痛较为常见。

第二，风湿性疾病，如患者存在风湿性疾病，可以引起疼痛，临床上主要表现为颈部、肩部、骨盆肌肉剧烈疼痛，伴有发热、抑郁、体重减轻等一些症状。

第三，自身免疫性疾病，包括系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、多发性肌炎、皮肌炎等全身免疫性疾病，主要由于过度免疫反应，导致大量免疫细胞和免疫球蛋白对接异常，从而损害正常组织，引起病变和功能性，出现全身肌肉酸痛，属于皮肤科和风湿科的诊疗范围。

第四，纤维肌痛综合症，是一种非关节炎性风湿病，临床上表现为骨骼系统的疼痛、发僵，诊断仍然存在异议。