大便的时候肚子痛，肛门痛，有可能是有两方面的原因，一方面是肚子里面有问题，比如肠炎、肠道的肿瘤等等。另外，肛门痛，有可能有痔疮、肛裂、肛周脓肿这些疾病。

要想明确诊断，最好还是到医院去就诊，让医生实际检查一下就知道了。通过肛门检查，可以发现肛门内一些疾病，比如痔疮、肛裂、肛窦炎、肛脓肿等等，可以采用药物来进行治疗，缓解症状。如果特别严重的，可能还需要手术治疗。而肠道有疾病，可以通过肠镜来进行检查，可以发现肠道的炎症或者肿瘤等等。明确诊断之后，采取针对性的治疗措施。