复杂性肛瘘手术因手术方式复杂、术后创面较大，大约需要1到2个月才能够完全恢复。

肛瘘术后创面通常是感染性、开放性的刀口，由于肛肠部位处于消化道的末端，患者一般每天会排大便1到2次，肛区创面会被污染，所以排大便后要及时清洗肛区创面，并且及时肛门部位特殊换药，可以降低术后肛门刀口感染的几率，提高治疗的效果，加速肛区创面的愈合。肛瘘手术后必须重视及时清洗、及时换药，清除创面周围的脓性分泌物，保持创面干燥，这样有利于肛瘘术后创面的愈合。