如果得了肛瘘对大便的影响是不会很大，肛瘘有可能会刺激导致总有排便的感觉，会刺激次大便次数增多。其余的对于大便没有什么太大的影响。

对于肛瘘的治疗，一般想彻底治好，需要手术来进行治疗，保守治疗，用药等是不会彻底根治。肛瘘手术需要将瘘管完整的切除，或者切开，去除里面的管道、肉芽组织，同时将肛瘘的内口切除，这样的话，剩下的新鲜创面逐渐愈合，能够达到治愈的目的。如果早期的单纯的肛瘘，长时间不去处理，不去治疗，时间久了，有可能会变成复杂性的肛瘘，那样治起来会更加的困难。