通常情况下，甲亢患者先去内分泌科进行检查和治疗，因为甲亢刚开始主要通过甲硫咪唑货或丙硫氧嘧啶药来治疗，治疗期间的复查和药物剂量调整也是在内分泌科进行。

若是药物治疗1到2年后，出现甲亢复发，若考虑碘131治疗，则可以前往核医学科进行。若考虑手术治疗，则可以前往普通外科或甲乳外科进行治疗。当发现甲状腺出现明显肿大或怀疑恶变时，也应该前往普外科或甲乳外科进行治疗。甲亢手术后的复查可以选择在普通外科、甲乳外科或者内分泌科进行。