月经快干净时有异味的原因可能是由于阴道有炎症或者是子宫内膜炎，甚至盆腔感染的风险，需要妇科检查看一下宫颈是否有举摆痛，子宫是否有压痛等表现，必要时需要予以抗感染治疗。

而在月经快干净时有异味，建议查白带常规明确病菌的类型，同时建议查支原体、衣原体是否有异常。若支原体医院体为阳性，需要结合口服阿奇霉素口服治疗，在治疗期间是不能同房的，而服用阿奇霉素停药之后两周到医院复查，同时也建议性伴侣到泌尿外科进一步的检查。