肺结合需要长期的抗结核治疗，结合药物具有一定的副作用，包括过敏反应可以表现为皮疹、皮肤瘙痒、过敏性休克、喉头水肿等。

有些患者服用结核药物，还可能会出现胃肠道症状，包括恶心、厌油、反酸，还可能会出现腹胀、腹痛等表现。有的还可能会出现神经系统症状出现头晕、头痛、幻觉等表现。还可能会导致肝功能和肾功能异常，出现转氨酶胆红素升高。也可能会导致高尿酸血症的发生，有的还可能会影响视力、听力等。所以要注意结合药物副作用的监测，比如利福平经常会导致肝功能损害，吡嗪酰胺会导致高尿酸血症等等。