牛奶蛋白过敏和乳糖不耐受的区别主要是发病的机制不同。蛋白过敏是孩子过敏引起的一系列症状，比如孩子会出现腹痛、腹泻、大便中带有血丝等一些症状。孩子往往属于过敏性体质，对于牛奶蛋白不能够良好的耐受，从而引起孩子出现一系列的过敏表现，而乳糖不耐受发生的原因是孩子肠道中的乳糖酶缺乏或者乳糖。阿梅的活性低下而引起的后果，这会引起孩子对于母乳中的乳糖不能够良好的分解，就会引起孩子由于肠道渗透压过高而造成的腹泻症状。