常见的有局部的疼痛、感染、出血、吻合口瘘、吻合口梗阻，还有可能会出现术后的吻合器导致的直肠刺激症，表现为大便次数增多、腹泻、里急后重感等。

低位直肠癌保肛手术可以有效的保持患者正常的解剖结构，减轻患者术后的心理负担，但是需要注意，患者术后可能出现的相关并发症，给予对症治疗来尽可能的提高患者的生存质量，同时需要结合术后病理分期以及是否有高危复发因素来选择术后的辅助放化疗，尽可能的提高患者的生存期，在治疗过程中也需要注意药物以及放疗所带来的不良反应，及时对症治疗才能保证所有治疗方案的顺利进行。