耐药性肺结核形成的原因是复杂的，主要包括细菌、治疗及规划等方面。

一、微生物方面的因素:

1、结核分枝杆菌的固有耐药性。

从未接触过某种药物，而固有的对其耐药的野生株，例如，牛分枝杆菌对吡嗪酰胺耐药。2、分枝杆菌的自然突变。在结核分枝杆菌的增殖过程中，由于自然突变，可导致少量耐药菌的产生。3、获得性耐药性。由于治疗不当等因素，导致敏感的主体菌群被杀灭，而少量自认耐药突变株成为优势菌群，而产生的获得性耐药。

二、治疗方面的因素。这种情况属于临床上多见，不正确的治疗，将导致耐药结核病的出现，从而影响患者治愈。1、单药治疗。单一药物治疗，将导致敏感菌株被杀灭，而耐药菌株逐步繁殖，成为优势菌株，从而导致患者，对使用的单一药物的耐药。2、此外，还有间断治疗。反复间断用药，耐药菌比例不断提高，最后成为优势菌群。3、还有治疗方案的不合理，药物剂量不足或者疗程不够，服药方式不合理或药物，吸收不佳等因素。三、是规划不完善。直接督导下的短程化疗，质量不佳。总之，耐药结核的产生，是一系列原因综合作用的结果，但人为的因素更为重要。因此，控制结核病，首先要提高治疗，和规划管理的治疗，这是预防耐药出现的最重要手段。