手足口传染源包括患者和隐性感染者。

流行期间患者为主要传染源，以发病后1周内，传染性最强。散发期间，隐性感染者为主要传染源，主要经过粪口途径传播，其次是经呼吸道飞沫传播，传染性较强。患者和病毒携带者的粪便、呼吸道分泌物及患者粘膜疱疹液中含有大量的病毒，接触其污染的手、日常用具、衣物以及医疗器具等均可感染。其中污染的手是传播中的关键媒介。在流行地区苍蝇、蟑螂可机械携带病毒，在传播中起一定作用。所以严格手卫生，也是切断传播途径的重要措施。