巧克力囊肿ca125是会升高的，但是ca125升高不代表一定有卵巢巧克力囊肿。

ca125是肿瘤标志物的其中一项，但是如果有炎症、卵巢上皮腺肿瘤也可以导致ca125明显升高。巧克力囊肿由于是子宫内膜异位症的一种表现，所以ca125数值也会升高，但具体是哪一种原因引起的，还需要结合b超检查、妇科双合诊检查以及患者的症状来综合分析判断。

巧克力囊肿一旦发现最好及时做手术治疗。