散瞳后主要的副作用为视近物不清，眼睛充血、出门怕光，这些均为正常的短期药物反应，不必过于担心和恐惧。

停药后一段时间后，上述症状均会逐渐消失。散瞳药是安全的，副作用是可控的，常常被用于某些眼科疾病的检查，诊断和治疗，例如用低浓度的阿托品滴眼液，控制低度数的近视进展，散瞳药入眼内后应立即按压内眼角，防止药水通过鼻泪管流入鼻腔，否则易出现短期面色潮红、口干、心跳加快等副作用，如果一旦出现，也不要紧张，只要对症处理即可。