肛瘘用啥药治疗，应该根据病情而定，1.非手术治疗，在肛瘘形成的初期以及进行术前准备时，可以采用温水坐浴，局部理疗以及使用抗生素药物等方式进行治疗。2.手术治疗，手术的原则是将肛瘘瘘管切开，必要时切除，敞开创面促进愈合，根据肛瘘瘘管的深浅，曲直度及其与肛门括约肌的关系，选用肛瘘切开及挂线术，需要注意手术中尽量减少对肛门括约肌的损伤，防止肛门失禁。