一旦发生了胚胎停止发育，一定要积极的终止妊娠，可以将绒毛或者是胎皮组织送染色体检查，这样可以同时查明原因，改善精卵的质量、提高精卵水平，预防再一次发生胚胎停止发育。

当出现胚胎停止发育时，母体会由于自我保护性尝试将胚胎排出体外，如果排出的彻底，成为自然流产。如果排出失败，导致残留，可称之为稽留流产。发生稽留流产，就需要积极的进行处理，尽快的排净胚胎组织，以免发生宫腔感染，影响母亲的健康和下一次的生育。出现稽留流产，可以根据停经周数的不同选择不同的引产方式，包括药物流产、手术流产和针刮术等等。