月经不调检查激素六项的时间应该是来月经的第2到4天。

空腹去医院抽血，在抽血的前一天要清淡饮食、充足睡眠，抽血当天要空腹抽血前需要静坐20分钟，这样检查结果会更准确。其余时间查激素六项，仅能作为参考，没有那么准确，只有月经期查激素六项能够反应卵巢的基础状态，才能知道有没有多囊卵巢综合症，或者是卵巢功能下降等等。查出来之后，根据具体的结果，年轻的女性一般用短效避孕药调理，年龄偏大，可能用地屈孕酮或者是芬吗通等来调理月经。月经不调有的时候会影响排卵，所以年轻的女性还是建议先用药物调理，然后再看卵泡情况。