针对细菌感染导致的毛囊炎，常用外用抗生素有莫匹罗星软膏、夫西地酸软膏、复方多粘菌素b软膏、克林霉素凝胶等。

针对真菌感染引起的毛囊炎，外用抗真菌药物有酮康唑乳膏、益康唑乳膏、盐酸特比萘芬凝胶等。如果病情严重，针对细菌感染常用的口服抗生素有头孢呋辛、头孢氨苄或多西环素等，针对真菌感染常用的抗真菌药物有伊曲康唑、氟康唑、盐酸特比萘芬等。如果毛囊炎继续发展为更大的疖或痈，可以选择局部麻醉，在无菌操作下切开病灶引出脓液。