孕13周胎停的原因很多，首先考虑的是胚胎本身的因素。

胚胎本身常见的是染色体的异常，会出现胎停，其次是母体的因素。母体合并中毒的贫血或者是心脏病或者是严重的病毒感染、高血压、肾病等。还有极度的营养不良，都可以造成胎停。还有内分泌的异常，常常出现，这种孕妇，孕前会有月经不规律的现象，黄体功能不全，孕期因为激素水平上不去造成胎停，还有免疫功能的异常。生殖器官的畸形，包括子宫三角、双子宫、子宫纵隔和宫腔粘连以及子宫肌瘤等等。还有受到创伤，比如过度的性交。过度的焦虑和恐惧等精神因素，还有孕妇的不良习惯，比如吸烟、喝酒、喝咖啡、吸毒等，均可以导致胎儿停止发育。