两侧肩胛骨酸疼，多考虑以下几点方面原因：

第一点，多考虑是颈椎病所导致的相关症状，这种情况下，建议行颈椎正侧位片、颈椎核磁共振，一般先以药物和改善患者生活方式进行治疗，看看相关症状是否有所缓解，必要时完善相关影像学检查后，以手术进行治疗，越早进行手术，效果越好。

第二点，多考虑是骨转移瘤所导致的相关症状，建议行全身骨显像检查一般来说，积极的行原发病灶的处理，必要时多考虑进行姑息治疗。