低位肛瘘术后一般大概需要2到3周可以痊愈，实际上肛瘘术后的愈合时间是没有固定的期限的，具体要看外瘘口距离肛门的远近，瘘管的深浅，以及瘘道的纤维硬化程度而定。

如果外瘘口距离肛门较近，且瘘管表浅，发病时间短瘘道纤维硬化程度轻，则手术后的创面就会短而浅，那么术后创面愈合的时间就会快。反之，如果外瘘口距离肛门较远，且瘘管较深，发病时间长瘘道的纤维硬化程度严重，则手术后的创面就会长而深，那么术后创面愈合的时间就会慢。肛瘘都是由于肛周脓肿治疗不当迁延而形成的，所以积极有效的治疗肛瘘才能减少肛瘘的发生。